De Vlaamse Auditautoriteit is het voorwerp van twee lopende audits.
- De Europese Rekenkamer (ERK) voerde een audit uit op onze werking voor EFRO;
- Een externe dienstverlener voert momenteel, in opdracht van de Waalse Auditautoriteit, een audit uit op onze werking voor Interreg Frankrijk-Wallonië-Vlaanderen.
Het ontwerpverslag van de ERK is in wederwoordfase. In het kader van de audit Interreg FWV vond reeds een opstartmeeting plaats.